Bằng chứng phôi sinh học so sánh dựa vào các điểm giống nhau và khác nhau giữa các loài về cấu tạo trong của các nội quan. các giai đoạn phát triển phôi thai. cấu tạo pôlipeptit hoặc pôlinuclêôtit. sinh học và biến cố địa chất.
